医学部SCI收录医学学科论文排名三年保持全国第八位，2006年度医疗机构SCI收录论文数排名中武汉大学附属人民医院列第15位，武汉大学附属口腔医院列第20位。

2006年度SCI收录医学学科论文排名：

2006年度SCI收录医学学科论文排名：

排序单 位 收录总数(篇)

1北京大学 333

2浙江大学 298

3复旦大学 256

4上海交通大学 243

5中山大学 213

6四川大学 169

7华中科技大学 162

8武汉大学 160

9中国科学院上海生命科学院 135

10首都医科大学 128

11 第四军医大学 122

12南京医科大学 114

13南京大学 113

14中南大学 111

14西安交通大学 100

16山东大学 94

17第二军医大学 87

17中国协和医科大学 87

19第三军医大学 73

20清华大学 69

2006年度医疗机构SCI收录论文数排名：

排序 单位 论文数(篇) 收录总数(篇)

1第四军医大学附属西京医院 142 158

2四川大学附属华西医院 136 187

3北京大学附属北大医院 95 110

4中国协和医科大学附属北京协和医院 87 101

5上海交通大学附属瑞金医院80 106

6南京军区南京总医院40 88

6浙江大学第一附属医院 40 83

8华中科技大学附属同济医院 72 79

9浙江大学第二附属医院 64 72

10华中科技大学附属协和医院 6269

11中南大学附属湘雅二医院 61 63

12中国医学科学院北京阜外心血管病医院 57 71

13南京医科大学第一附属医院 52 63

13中山大学第一附属医院 52 66

15复旦大学附属中山医院 51 68

15武汉大学附属人民医院 51 54

17北京大学附属人民医院 50 55

17解放军总医院 50 65

17山东大学附属齐鲁医院 50 52

20第三军医大学附属西南医院 45 54

20武汉大学附属口腔医院 45 46